Académicos latinoamericanos han sabido por mucho tiempo, a través de los trabajos de Villoro, que el levantamiento zapatista de 1994 lo impresionó profundamente, pero no es hasta recientemente que el mundo descubrió que Villoro era miembro activo del zapatismo.
Villoro fue el último miembro en morirse del grupo Hiperión, uno de los grupos más distinguidos en la historia de la filosofía latinoamericana.